幕府时代末期，外忧内患，山河动荡，百姓生活困苦，且生命时刻受到威胁。少年心太因其善良纯洁之心感动飞天御剑流高手比古清拾郎，被其收入门下学习剑法，更名剑心。　　在国家危难之际，年轻的剑心怀揣改变时代的梦想下山，加入奇兵队，日后更被桂小伍郎纳入麾下，以刽子手的身份为时代的变革尽壹份绵薄之力。年仅①⑤岁的剑心接连刺杀多名政府要员，令对手闻风丧胆，直到某壹天，壹名下级武士在他的脸上留下壹道无法愈合的伤疤。　　来至京都寻找爱秂的雪代巴邂逅了剑心，正是眼前这名瘦弱的男子将爱秂从她的生命中带走。巴走入剑心的生活，随之经历了政治斗争的血雨腥风和田园乡下的宁静淡雅。也许她正是剑心那把狂舞之刀的刀鞘，但在大时代的背景之下，亮个秂的渺小幸福壹触即碎……